Самую глубокую часть океана называют глубинной зоной, здесь обитают тысячи разновидностей беспозвоночных и рыб, включая такие причудливые разновидности, как Рыба Рыболов, так названная, потому что она использует биолюммисенцию (особое природное свечение), чтобы привлечь свою добычу. Впадина Челленджера в Марианском желобе очень холодное место, и обладает высокой степенью герметизации; ее дно покрыто гидротермальными (с горячей водой) вентилями, сформированными расхождениями архитектурных пластин земной коры, которые выпускают водородный сульфид и другие химические элементы, которые потребляются барофилическими бактериями, которые затем потребляются другими микроорганизмами, которые в свою очередь, потребляются рыбой, и так далее по пищевой цепи. Температура вокруг вентилей может достигать 300 ° по Цельсию (572 ° по Фаренгейту). Жидкость является очень кислой, в то время как вода с глубин океана является не очень соленой. Хотя постоянный приток жидкости препятствует тому, чтобы вода около вентилей кипела, существа из глубоководных мест оказывают невероятное сопротивление температурным крайностям при наличии различных белков, которые приспособлены к жизни при таких условиях окружающей среды. Самые стойкие к высоким температурам бактерии могут противостоять температуре в 113 ° по Цельсию (235 ° по Фаренгейту), в то время как этот порог для животных опускается до 50 ° по Цельсию (122 ° по Фаренгейту). Единственное животное, которое чувствует себя комфортно около гидротермальных вентилей — это Bythograea thermydron или «вентильный краб» — их численность настолько велика, что ученые используют группы крабов для определения местонахождение гидротермальных вентилей. Крабы и Рыба Рыболов — одни из многих разновидностей живых организмов, которые обитают в Марианском желобе. В одном образце грязи, взятом Челленджером и Каико, было найдено более чем 200 различных микроорганизмов. Хотя многие организмы обитают на этих глубинах, ни один человек не смог бы противостоять крайностям давления и температур. Другая интересная особенность этих глубоководных морских существ — их долговечность; многие из этих животных, имеют продолжительность жизни более чем сто лет, при условии, конечно, что они не попали в рыболовные сети. Так как эти существа редко мигрируют и достаточно медленно развиваются, наблюдается возрастающее беспокойство относительно последствий человеческой деятельности на дне океана.
Глубины океанов нашей планеты являются очень темными. На глубине 150 метров (приблизительно 500 футов) практически нет света, который мог быть видим человеческим глазом. Как не парадоксально, но современный человек знает гораздо больше о космосе, чем о глубоких водах океанов собственной планеты. Океаническое дно на глубине состоит из морского осадка, также известного как биогенный «ил». Морской осадок составлен из раковин, скелетов животных, разлагающих органику микроорганизмов и растений; по цвету является желтоватым и имеет очень вязкую консистенцию.